MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYptb32953

Total Repeats: 505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006154	AAT	2	6	238	243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593943
2	NC_006154	ACA	2	6	260	265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593943
3	NC_006154	ATAG	2	8	310	317	50 %	25 %	25 %	0 %	51593943
4	NC_006154	TA	3	6	341	346	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
5	NC_006154	CTG	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593943
6	NC_006154	TCA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593943
7	NC_006154	A	6	6	411	416	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
8	NC_006154	TCG	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593943
9	NC_006154	A	6	6	436	441	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
10	NC_006154	GAA	2	6	468	473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593943
11	NC_006154	ATG	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593943
12	NC_006154	TC	3	6	560	565	0 %	50 %	0 %	50 %	51593943
13	NC_006154	TTTA	2	8	578	585	25 %	75 %	0 %	0 %	51593943
14	NC_006154	AAAG	2	8	594	601	75 %	0 %	25 %	0 %	51593943
15	NC_006154	TTTGC	2	10	652	661	0 %	60 %	20 %	20 %	51593943
16	NC_006154	TA	3	6	665	670	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
17	NC_006154	TTA	2	6	722	727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593943
18	NC_006154	GAAA	2	8	756	763	75 %	0 %	25 %	0 %	51593943
19	NC_006154	AG	3	6	806	811	50 %	0 %	50 %	0 %	51593943
20	NC_006154	AT	3	6	812	817	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
21	NC_006154	TAAT	2	8	836	843	50 %	50 %	0 %	0 %	51593943
22	NC_006154	GAA	2	6	922	927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593943
23	NC_006154	A	7	7	926	932	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
24	NC_006154	AGA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593943
25	NC_006154	TAT	2	6	1032	1037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593943
26	NC_006154	GAGT	2	8	1038	1045	25 %	25 %	50 %	0 %	51593943
27	NC_006154	A	6	6	1048	1053	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
28	NC_006154	A	6	6	1079	1084	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
29	NC_006154	A	7	7	1101	1107	100 %	0 %	0 %	0 %	51593943
30	NC_006154	ATT	2	6	1126	1131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593943
31	NC_006154	TAA	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593943
32	NC_006154	GTA	2	6	1415	1420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593944
33	NC_006154	GGT	2	6	1421	1426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593944
34	NC_006154	A	8	8	1474	1481	100 %	0 %	0 %	0 %	51593944
35	NC_006154	T	7	7	1539	1545	0 %	100 %	0 %	0 %	51593944
36	NC_006154	ACAA	2	8	1573	1580	75 %	0 %	0 %	25 %	51593944
37	NC_006154	ATT	2	6	1586	1591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593944
38	NC_006154	ATTT	2	8	1611	1618	25 %	75 %	0 %	0 %	51593944
39	NC_006154	AGA	2	6	1917	1922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593945
40	NC_006154	GAT	2	6	1940	1945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593945
41	NC_006154	TCT	2	6	1955	1960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593945
42	NC_006154	CAA	2	6	1977	1982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593945
43	NC_006154	ATTTT	2	10	2013	2022	20 %	80 %	0 %	0 %	51593945
44	NC_006154	CTA	2	6	2036	2041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593945
45	NC_006154	ATCTAA	2	12	2047	2058	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	51593945
46	NC_006154	TAA	2	6	2116	2121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593945
47	NC_006154	CTG	2	6	2582	2587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593946
48	NC_006154	A	8	8	2699	2706	100 %	0 %	0 %	0 %	51593946
49	NC_006154	TAA	2	6	2721	2726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593946
50	NC_006154	AGA	2	6	2727	2732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593946
51	NC_006154	ATCA	2	8	2797	2804	50 %	25 %	0 %	25 %	51593946
52	NC_006154	TCTG	2	8	2862	2869	0 %	50 %	25 %	25 %	51593946
53	NC_006154	AAT	2	6	2880	2885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593946
54	NC_006154	GTT	2	6	2930	2935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593946
55	NC_006154	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593946
56	NC_006154	A	6	6	2965	2970	100 %	0 %	0 %	0 %	51593946
57	NC_006154	CG	3	6	3004	3009	0 %	0 %	50 %	50 %	51593946
58	NC_006154	CAC	2	6	3023	3028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593946
59	NC_006154	G	6	6	3149	3154	0 %	0 %	100 %	0 %	51593946
60	NC_006154	TCG	2	6	3158	3163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593946
61	NC_006154	GTT	2	6	3199	3204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593947
62	NC_006154	A	6	6	3207	3212	100 %	0 %	0 %	0 %	51593947
63	NC_006154	CATCC	2	10	3230	3239	20 %	20 %	0 %	60 %	51593947
64	NC_006154	TGTC	2	8	3339	3346	0 %	50 %	25 %	25 %	51593947
65	NC_006154	TGGG	2	8	3371	3378	0 %	25 %	75 %	0 %	51593947
66	NC_006154	ATT	2	6	3428	3433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593947
67	NC_006154	ATT	2	6	3446	3451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593947
68	NC_006154	GTT	2	6	3472	3477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593947
69	NC_006154	TTA	2	6	3570	3575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593948
70	NC_006154	GGC	2	6	3598	3603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593948
71	NC_006154	CAA	2	6	3615	3620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593948
72	NC_006154	TTC	2	6	3626	3631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593948
73	NC_006154	GTG	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593948
74	NC_006154	TGGC	2	8	3761	3768	0 %	25 %	50 %	25 %	51593948
75	NC_006154	TCA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593948
76	NC_006154	G	6	6	3923	3928	0 %	0 %	100 %	0 %	51593948
77	NC_006154	GT	3	6	3930	3935	0 %	50 %	50 %	0 %	51593948
78	NC_006154	CGA	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593948
79	NC_006154	ATA	2	6	4032	4037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593948
80	NC_006154	CAA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593948
81	NC_006154	TGA	2	6	4090	4095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
82	NC_006154	ATG	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
83	NC_006154	C	6	6	4175	4180	0 %	0 %	0 %	100 %	51593948
84	NC_006154	GAAA	2	8	4199	4206	75 %	0 %	25 %	0 %	51593948
85	NC_006154	CGC	2	6	4296	4301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593948
86	NC_006154	GAA	2	6	4328	4333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593948
87	NC_006154	GTG	2	6	4340	4345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593948
88	NC_006154	CTT	2	6	4372	4377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593948
89	NC_006154	A	6	6	4395	4400	100 %	0 %	0 %	0 %	51593948
90	NC_006154	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593948
91	NC_006154	ATT	2	6	4524	4529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593948
92	NC_006154	AGG	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593948
93	NC_006154	GAT	2	6	4673	4678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
94	NC_006154	GACT	2	8	4693	4700	25 %	25 %	25 %	25 %	51593948
95	NC_006154	AGC	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593948
96	NC_006154	AGT	2	6	4934	4939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
97	NC_006154	GC	3	6	5043	5048	0 %	0 %	50 %	50 %	51593948
98	NC_006154	CTG	2	6	5072	5077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593948
99	NC_006154	A	7	7	5097	5103	100 %	0 %	0 %	0 %	51593948
100	NC_006154	GCTG	2	8	5160	5167	0 %	25 %	50 %	25 %	51593948
101	NC_006154	ATG	2	6	5174	5179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
102	NC_006154	GCA	2	6	5191	5196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593948
103	NC_006154	A	8	8	5219	5226	100 %	0 %	0 %	0 %	51593948
104	NC_006154	G	6	6	5288	5293	0 %	0 %	100 %	0 %	51593948
105	NC_006154	TCA	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593948
106	NC_006154	G	8	8	5593	5600	0 %	0 %	100 %	0 %	51593948
107	NC_006154	AGTG	2	8	5645	5652	25 %	25 %	50 %	0 %	51593948
108	NC_006154	TG	3	6	5698	5703	0 %	50 %	50 %	0 %	51593948
109	NC_006154	TGT	2	6	5724	5729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593948
110	NC_006154	TGGA	2	8	5748	5755	25 %	25 %	50 %	0 %	51593948
111	NC_006154	TGA	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593948
112	NC_006154	AAG	2	6	5813	5818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593948
113	NC_006154	TCT	2	6	5830	5835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593948
114	NC_006154	GT	3	6	6332	6337	0 %	50 %	50 %	0 %	51593949
115	NC_006154	CTG	2	6	6345	6350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593949
116	NC_006154	CGG	2	6	6382	6387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593949
117	NC_006154	TAT	2	6	6389	6394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593949
118	NC_006154	A	7	7	6592	6598	100 %	0 %	0 %	0 %	51593949
119	NC_006154	G	6	6	6629	6634	0 %	0 %	100 %	0 %	51593949
120	NC_006154	AGC	2	6	6655	6660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593949
121	NC_006154	CAATGA	2	12	6692	6703	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	51593949
122	NC_006154	TTA	2	6	6715	6720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593949
123	NC_006154	GCAA	2	8	6727	6734	50 %	0 %	25 %	25 %	51593949
124	NC_006154	GTG	2	6	6738	6743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593949
125	NC_006154	AG	3	6	6764	6769	50 %	0 %	50 %	0 %	51593949
126	NC_006154	CAG	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593949
127	NC_006154	GAC	2	6	6911	6916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593949
128	NC_006154	ATTG	2	8	6962	6969	25 %	50 %	25 %	0 %	51593949
129	NC_006154	ACAA	2	8	6970	6977	75 %	0 %	0 %	25 %	51593949
130	NC_006154	CAG	2	6	6996	7001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593949
131	NC_006154	GGC	2	6	7135	7140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593950
132	NC_006154	GT	3	6	7204	7209	0 %	50 %	50 %	0 %	51593950
133	NC_006154	GTC	2	6	7291	7296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593950
134	NC_006154	GAA	2	6	7301	7306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593950
135	NC_006154	TGAA	2	8	7342	7349	50 %	25 %	25 %	0 %	51593950
136	NC_006154	GCA	2	6	7392	7397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593951
137	NC_006154	A	7	7	7405	7411	100 %	0 %	0 %	0 %	51593951
138	NC_006154	AAGGAA	2	12	7463	7474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593951
139	NC_006154	TCG	2	6	7515	7520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593951
140	NC_006154	AGA	2	6	7527	7532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593951
141	NC_006154	ATT	2	6	7592	7597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593951
142	NC_006154	TGCGTC	2	12	7747	7758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593952
143	NC_006154	GCG	2	6	7760	7765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593952
144	NC_006154	TTG	2	6	7766	7771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593952
145	NC_006154	AGA	2	6	7783	7788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593952
146	NC_006154	TGC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593952
147	NC_006154	GAG	2	6	7917	7922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593952
148	NC_006154	AATTC	2	10	7944	7953	40 %	40 %	0 %	20 %	51593952
149	NC_006154	T	7	7	7983	7989	0 %	100 %	0 %	0 %	51593953
150	NC_006154	ACG	2	6	8002	8007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593953
151	NC_006154	CAC	2	6	8022	8027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593953
152	NC_006154	TGG	2	6	8078	8083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593953
153	NC_006154	G	6	6	8128	8133	0 %	0 %	100 %	0 %	51593953
154	NC_006154	G	7	7	8211	8217	0 %	0 %	100 %	0 %	51593953
155	NC_006154	GCC	2	6	8287	8292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593953
156	NC_006154	CGG	2	6	8429	8434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593953
157	NC_006154	TTTG	2	8	8498	8505	0 %	75 %	25 %	0 %	51593953
158	NC_006154	TCC	2	6	8516	8521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593953
159	NC_006154	T	6	6	8552	8557	0 %	100 %	0 %	0 %	51593953
160	NC_006154	GTT	2	6	8574	8579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593953
161	NC_006154	CGA	2	6	8649	8654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593953
162	NC_006154	CT	3	6	8701	8706	0 %	50 %	0 %	50 %	51593953
163	NC_006154	GCC	2	6	8827	8832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593953
164	NC_006154	AGG	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593953
165	NC_006154	GGT	2	6	8878	8883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593953
166	NC_006154	GCA	2	6	8896	8901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593953
167	NC_006154	GC	3	6	8915	8920	0 %	0 %	50 %	50 %	51593953
168	NC_006154	CAG	2	6	8921	8926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593953
169	NC_006154	GCA	2	6	8938	8943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593953
170	NC_006154	GCC	2	6	8953	8958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593953
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173	NC_006154	T	6	6	9273	9278	0 %	100 %	0 %	0 %	51593954
174	NC_006154	TTA	2	6	9294	9299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593954
175	NC_006154	TAA	2	6	9325	9330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593954
176	NC_006154	TGT	2	6	9331	9336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593954
177	NC_006154	TA	3	6	9364	9369	50 %	50 %	0 %	0 %	51593954
178	NC_006154	ATA	2	6	9376	9381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593954
179	NC_006154	GCC	2	6	9459	9464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593954
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181	NC_006154	AAT	2	6	9635	9640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593954
182	NC_006154	G	6	6	9859	9864	0 %	0 %	100 %	0 %	51593954
183	NC_006154	AAT	2	6	9865	9870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593954
184	NC_006154	TAA	2	6	9880	9885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593955
185	NC_006154	AT	3	6	9894	9899	50 %	50 %	0 %	0 %	51593955
186	NC_006154	GTTGT	2	10	9908	9917	0 %	60 %	40 %	0 %	51593955
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189	NC_006154	T	6	6	9948	9953	0 %	100 %	0 %	0 %	51593955
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201	NC_006154	A	6	6	10459	10464	100 %	0 %	0 %	0 %	51593955
202	NC_006154	ATG	3	9	10542	10550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593955
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204	NC_006154	TA	3	6	10605	10610	50 %	50 %	0 %	0 %	51593955
205	NC_006154	GGTGAT	2	12	10666	10677	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	51593955
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239	NC_006154	TGCA	2	8	12424	12431	25 %	25 %	25 %	25 %	51593957
240	NC_006154	ACA	2	6	12455	12460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593957
241	NC_006154	TCA	2	6	12600	12605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593957
242	NC_006154	CTG	2	6	12676	12681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593957
243	NC_006154	GTT	2	6	12705	12710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593957
244	NC_006154	GT	3	6	12720	12725	0 %	50 %	50 %	0 %	51593957
245	NC_006154	GAC	2	6	12774	12779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593957
246	NC_006154	ATT	2	6	13018	13023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593957
247	NC_006154	ATG	2	6	13034	13039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593957
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255	NC_006154	GTG	2	6	13515	13520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593958
256	NC_006154	CAG	2	6	13550	13555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593958
257	NC_006154	A	7	7	14074	14080	100 %	0 %	0 %	0 %	51593959
258	NC_006154	CT	3	6	14083	14088	0 %	50 %	0 %	50 %	51593959
259	NC_006154	GGC	2	6	14091	14096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593959
260	NC_006154	ATT	2	6	14116	14121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593959
261	NC_006154	GTG	2	6	14155	14160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593959
262	NC_006154	T	6	6	14226	14231	0 %	100 %	0 %	0 %	51593959
263	NC_006154	AAAG	2	8	14250	14257	75 %	0 %	25 %	0 %	51593959
264	NC_006154	GCG	2	6	14289	14294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593959
265	NC_006154	TTA	2	6	14299	14304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593959
266	NC_006154	CAT	2	6	14343	14348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593959
267	NC_006154	AT	3	6	14515	14520	50 %	50 %	0 %	0 %	51593960
268	NC_006154	T	6	6	14556	14561	0 %	100 %	0 %	0 %	51593960
269	NC_006154	TCA	2	6	14609	14614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593960
270	NC_006154	CGG	2	6	14623	14628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593960
271	NC_006154	TAA	2	6	14629	14634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593960
272	NC_006154	TTG	2	6	14637	14642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593960
273	NC_006154	G	8	8	14669	14676	0 %	0 %	100 %	0 %	51593960
274	NC_006154	G	6	6	14696	14701	0 %	0 %	100 %	0 %	51593960
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290	NC_006154	TAA	2	6	15214	15219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593960
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391	NC_006154	C	8	8	20558	20565	0 %	0 %	0 %	100 %	51593971
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402	NC_006154	CTTT	2	8	21003	21010	0 %	75 %	0 %	25 %	51593971
403	NC_006154	GT	3	6	21183	21188	0 %	50 %	50 %	0 %	51593972
404	NC_006154	C	6	6	21211	21216	0 %	0 %	0 %	100 %	51593972
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499	NC_006154	CGC	2	6	27257	27262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593983
500	NC_006154	GTT	2	6	27267	27272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593983

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